Родился 28 января 1979 года в Ленинграде.
Образование — СПбГУ.
До октября 2012 года являлся членом политсовета оппозиционного демократического движения "Солидарность" в Санкт-Петербурге, психолог. Сын диссидента Льва Яковлевича Волохонского.
Закончил кафедру общей психологии СПбГУ в 2002 году. В дальнейшем преподавал и занимался научной работой на факультете психологии СПбГУ, основал СНО факультета. Активно участвует в общественной жизни университета. Сфера научных интересов: психология межличностного общения в интернете, психология принятия решений, психосемантика.
С 2009 года по октябрь 2012 года — член петербургского политсовета оппозиционного демократического движения "Солидарность".
Осенью 2011 года баллотировался в Законодательное собрание Санкт-Петербурга по спискам партии "Яблоко".
В октябре 2012 года снял свою кандидатуру с выборов координационного совета "Солидарности" в связи с несогласием с решением организации, фактически ограничивающим ее возможности объединения с рядом оппозиционных организаций при проведении протестных акций.
Являлся журналистом издания "Троицкий вариант — Наука". Ведет независимый интернет-проект Новости СПбГУ, а также некоторые другие ("Музыка оппозиции", "Кремлингремлин", "Новости Купчино").
В сентябре 2019 года избран депутатом МО №72.
Дата избрания: 08.09.19
Субъект выдвижения: Партия роста
Сведения об избрании (источник):
Получил 606 голосов.
В марте 2022 года уехал из России после обыска в его квартире в связи с делом о ложном сообщении о теракте. В ноябре 2023 года стало известно о трех уголовных делах, возбужденных в отношении Волохонского: о призывах к терроризму (ст. 205.2 УК), о распространении фейков о Вооруженных силах (ст. 207.3 УК), а также о повторной дискредитации армии (ст. 280.3 УК). Октябрьский районный суд вынес решение о заочном аресте муниципального депутата, он был объявлен в международный розыск.
Росфинмониторинг внес Владимира Волохонского в реестр террористов и экстремистов.
21 июня 2024 года Минюст внес Владимира Волохонского в реестр иностранных агентов.